Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms