Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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