Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms