Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MATN4O95460 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MATN4O95460 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MATN4O95460 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MATN4O95460 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MATN4O95460 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MATN4O95460 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MATN4O95460 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MATN4O95460 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MATN4O95460 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms