Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CALUO43852 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALUO43852 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALUO43852 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms