Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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ARHGEF10O15013 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF10O15013 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF10O15013 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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