Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms