Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ATG4BQ9Y4P1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4BQ9Y4P1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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