Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXND1Q9Y4D7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms