Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIT1Q9Y2X7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms