Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms