Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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