Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VN1R3Q9BXE9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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