Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms