Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms