Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms