Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGDCC3Q8IVU1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms