Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRT80Q6KB66 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms