Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms