Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEF1DP3Q658K8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms