Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms