Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAMK4Q16566 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAMK4Q16566 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms