Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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