Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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