Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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