Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms