Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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