Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms