Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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