Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms