Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EP300Q09472 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EP300Q09472 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms