Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TYRO3Q06418 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms