Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms