Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms