Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COG7P83436 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COG7P83436 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COG7P83436 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms