Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP46P62068 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP46P62068 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP46P62068 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms