Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms