Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1P52655 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1P52655 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1P52655 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms