Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NESP48681 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NESP48681 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NESP48681 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms