Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM23P36406 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM23P36406 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM23P36406 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms