Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPB2P35606 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPB2P35606 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPB2P35606 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPB2P35606 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPB2P35606 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPB2P35606 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms