Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL9P32969 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL9P32969 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL9P32969 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms