Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms