Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRCP23327 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRCP23327 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRCP23327 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HRCP23327 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HRCP23327 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HRCP23327 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HRCP23327 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HRCP23327 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRCP23327 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms