Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGAP02671 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGAP02671 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGAP02671 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGAP02671 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms