Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms