Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYNGR2O43760 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms