Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms