Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PCH4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PCH4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PCH4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PCH4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PCH4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms