Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC169A6NNP5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms